什麼是 Protein Precipitation？從蛋白質沉澱了解樣品前處理

在生物樣品分析中，例如血液、血漿、血清或細胞培養液，樣品中通常含有大量蛋白質。若直接進行後續分析，這些蛋白質可能造成基質干擾、影響分析結果，甚至增加分析儀器污染的風險。 

Protein Precipitation（蛋白質沉澱，PPT） 是一種常見且操作相對簡單的樣品前處理方式，主要原理是利用 Acetonitrile（ACN）、Methanol（MeOH）等有機溶劑，降低蛋白質在溶液中的溶解度，使蛋白質變性並形成沉澱。經過充分混合後，再透過離心將蛋白質沉澱與液相分離，最後取出含有目標分析物的上清液（Supernatant），進行後續分析。 

基本流程通常為：： 

樣品 → 加入沉澱溶劑 → 混合 → 離心 → 取上清液 → 後續分析 

例如在血漿樣品的分析中，加入適當比例的 Acetonitrile 後，血漿中的蛋白質會逐漸形成沉澱，而許多小分子分析物則仍保留在液相中。透過離心將蛋白質與液相分離後，即可移取上清液作為後續分析的樣品

相較於其他較複雜的樣品前處理方式，Protein Precipitation 的優點是流程簡單、處理速度快，且容易應用於大量樣品。但實際操作時，樣品與沉澱溶劑的比例、混合方式、混合時間、離心條件，以及上清液的移取方式，都可能影響最終樣品的品質與分析結果。因此，當樣品數量從少量逐漸增加到數十甚至數百個時，如何維持每個樣品相同的操作條件與處理一致性，就成為 Protein Precipitation 樣品前處理中值得注意的課題。